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ロゼッタストーン

今日でようやくトレーニングが終了しました~

今回のトレーニングは、LC/MSのデータを解析するソフトウェアの3日間トレーニングでした。

LC/MS は? というと、液体クロマトグラフィーとマススペクトロメトリーという装置の組み合わせなのですが、細かなことを説明しだすと大変なので(知識も足りないし・・・)、ひとまずタンパク質を分離して、同定するもの(そのタンパク質は何だったのか?)というようなことを調べる装置として許していただきたいと思います。

ソフトウェア側では、それらのデータを見やすいビューで比較したり、タンパク質の情報を公共のデータベースと比較をして、同定をしたり、タンパク質の情報を付加してさらなる解析を行なったりするものです。

プロダクトマネージャーの人の話が、一番イメージしやすい流れだったので、それを引用すると、HIVウィルスが感染した細胞と、してない細胞を比較しどういうタンパク質が感染によってでてきているか、さらに感染後12時間に表れるタンパク質と、36時間後に表れるタンパク質にどんな違いがあるか、などを解析するようなソフトになります。その前段階として、機械で検出されたタンパク質が本当にそのタンパク質なのかを精度よく調べてくる、という事もとても大切なステップです。

今まではRNAがらみのことが多かったのですが、とうとうタンパク質かぁという感じです。去年のトレーニングでは、液体クロマトグラフィーやマススペクトロメトリーなどのバックグラウンドがメインで、今回は製品の細かな仕様を教えてもらいながら、製品の理解を深めるという感じでした。USだと開発のディベロッパーの人たちもすぐその辺にいるので、みんなでトレーニングを受けながら、やんやかトレーナーの人に質問し、わからなくなるとディベロッパーの人を呼んで、どうなってるのかを説明してもらったり、アルゴリズム関係で分からなければ、開発した人をよんでくるなど、いつもながら面白いトレーニングです。トレーナーの人も、私達に教えながら、確認したり、自分の理解が甘い点を確認している感じです。朝早いのがちょっと難でしたが、いつもドーナツやベーグルがあったので、まぁ我慢するか、というところです。

昔の会社で液体クロマトグラフィーを販売していたので、その辺は特に理解が難しいわけでもなく、マススペクトロメトリーも、昔協業の話があり、その当時はその会社へ見学へ行きいろいろ教えてもらって勉強していたので、思わぬところで、そんな経験が活かされている感じです。それでも、やはりこの業界は日進月歩で私が知っていた頃よりも、ずっと進んでいるので、全く新しい感じもし、いい刺激になったと思います。

年内には、ゲノムよりな製品もリリースするらしく、ロゼッタストーンに3種類の文字が載る日も、思ったよりは遠くないのかもと思う出張でした。

今度行なうセミナーも、登録状況が思ったよりも好調なので、よしもう一分張り!という気持ちになってきました。

ショッピングも、履きやすい赤いパンプスをゲットし、まぁまぁというところです。

さてさて、これからはホテルで来週の修士論文のセミナーの資料まとめの続きです。。。
by biostat_cat | 2006-04-08 14:21 | 徒然 | Trackback | Comments(0)

オージーの旦那様と2匹の猫らとののんびりライフ。ブログのタイトルはイタリア語で「ネコの足跡」という意味。私の足跡の記録です。コメント大歓迎☆


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